臨床顯微鏡照明系統

透射光應用是臨床顯微鏡中最常見的應用。這些應用包括，在顯微鏡玻片上主要的亮場中使用彩色顯微鏡來用於識別組織，細胞和微生物。其它技術包括偏光顯微鏡對晶體和其他成分，例如：澱粉樣物質（二色）。
相位對比技術可用於觀察其中對比度相對較低的未染色樣品。該方法使用光學，人為地增加折射率的差異，以產生高反差的圖像，成本相對較低。例如用於spermatazoa或組織培養。